A segunda guerra mundial de 1946 devastou praticamente toda a Europa, as forças nazistam viraram a guerra de uma maneira surpreendente enquanto estavam sob um ataque em massa, utilizando robôs de combate de um projeto chamado Deathshead. O time Aliado manda um ataque final aos nazistas e falham, tirando a última fagulha de esperança que os envolvia.
Assim então, o regime nazista domina o planeta inteiro e faz até os mais poderosos países se renderem a sua causa, controlando o planeta com uma mão de ferro. Você é um herói de guerra chamado Blazkowicz e cabe a você acabar com um exército incontrolável de robôs e super soldados, somente você poderá reescrever a história.